Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRN3Q9NYV6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms