Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTMR4Q9NYA4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR4Q9NYA4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms