Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms