Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF38Q9NXL2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms