Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED29Q9NX70 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms