Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms