Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106BQ9NUM4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms