Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOMER2Q9NSB8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOMER2Q9NSB8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOMER2Q9NSB8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOMER2Q9NSB8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOMER2Q9NSB8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOMER2Q9NSB8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOMER2Q9NSB8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOMER2Q9NSB8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOMER2Q9NSB8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOMER2Q9NSB8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOMER2Q9NSB8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOMER2Q9NSB8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOMER2Q9NSB8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOMER2Q9NSB8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOMER2Q9NSB8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOMER2Q9NSB8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOMER2Q9NSB8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOMER2Q9NSB8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOMER2Q9NSB8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOMER2Q9NSB8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOMER2Q9NSB8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOMER2Q9NSB8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOMER2Q9NSB8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HOMER2Q9NSB8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOMER2Q9NSB8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOMER2Q9NSB8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOMER2Q9NSB8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOMER2Q9NSB8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOMER2Q9NSB8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms