Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms