Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PHPT1Q9NRX4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms