Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TMPRSS4Q9NRS4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms