Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF3Q9NR81 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms