Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A4GALTQ9NPC4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
A4GALTQ9NPC4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms