Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms