Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUFT1Q9NNX1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms