Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD45

TM9SF3, Transmembrane 9 superfamily member 3, humanhuman

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Length 589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF3Q9HD45 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TM9SF3Q9HD45 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM9SF3Q9HD45 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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