Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMURF1Q9HCE7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms