Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C5orf42Q9H799 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C5orf42Q9H799 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C5orf42Q9H799 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C5orf42Q9H799 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C5orf42Q9H799 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C5orf42Q9H799 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C5orf42Q9H799 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C5orf42Q9H799 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C5orf42Q9H799 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C5orf42Q9H799 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C5orf42Q9H799 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C5orf42Q9H799 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C5orf42Q9H799 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C5orf42Q9H799 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C5orf42Q9H799 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C5orf42Q9H799 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C5orf42Q9H799 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C5orf42Q9H799 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C5orf42Q9H799 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C5orf42Q9H799 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C5orf42Q9H799 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C5orf42Q9H799 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.27
C5orf42Q9H799 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C5orf42Q9H799 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms