Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E7

DEF6, Differentially expressed in FDCP 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEF6Q9H4E7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DEF6Q9H4E7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DEF6Q9H4E7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DEF6Q9H4E7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DEF6Q9H4E7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DEF6Q9H4E7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms