Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF3Q9H094 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF3Q9H094 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF3Q9H094 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF3Q9H094 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF3Q9H094 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF3Q9H094 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF3Q9H094 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF3Q9H094 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF3Q9H094 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF3Q9H094 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF3Q9H094 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF3Q9H094 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms