Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H2

TTYH3, Protein tweety homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTYH3Q9C0H2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTYH3Q9C0H2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTYH3Q9C0H2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTYH3Q9C0H2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TTYH3Q9C0H2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTYH3Q9C0H2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTYH3Q9C0H2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTYH3Q9C0H2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTYH3Q9C0H2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTYH3Q9C0H2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTYH3Q9C0H2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTYH3Q9C0H2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTYH3Q9C0H2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTYH3Q9C0H2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTYH3Q9C0H2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTYH3Q9C0H2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTYH3Q9C0H2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTYH3Q9C0H2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTYH3Q9C0H2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTYH3Q9C0H2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms