Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 753.6 ms