Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCAPERQ9BY12 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
SCAPERQ9BY12 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms