Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms