Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms