Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
THUMPD2Q9BTF0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
THUMPD2Q9BTF0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms