Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDHD3Q9BSH5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDHD3Q9BSH5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms