Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERPUD2Q9BSE4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HERPUD2Q9BSE4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms