Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms