Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM2D3Q9BRN9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM2D3Q9BRN9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM2D3Q9BRN9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM2D3Q9BRN9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM2D3Q9BRN9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM2D3Q9BRN9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM2D3Q9BRN9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM2D3Q9BRN9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms