Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms