Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms