Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms