Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA1CQ9BQE3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA1CQ9BQE3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA1CQ9BQE3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA1CQ9BQE3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA1CQ9BQE3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA1CQ9BQE3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA1CQ9BQE3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA1CQ9BQE3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA1CQ9BQE3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA1CQ9BQE3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA1CQ9BQE3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA1CQ9BQE3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA1CQ9BQE3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms