Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
NPAS2Q99743 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NPAS2Q99743 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NPAS2Q99743 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NPAS2Q99743 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NPAS2Q99743 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NPAS2Q99743 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS2Q99743 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS2Q99743 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS2Q99743 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS2Q99743 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS2Q99743 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS2Q99743 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS2Q99743 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS2Q99743 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS2Q99743 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS2Q99743 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS2Q99743 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS2Q99743 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS2Q99743 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS2Q99743 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS2Q99743 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS2Q99743 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS2Q99743 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NPAS2Q99743 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS2Q99743 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS2Q99743 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS2Q99743 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms