Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF3CQ99613 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms