Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms