Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
ALS2Q96Q42 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms