Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNT1Q96Q11 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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