Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY8

NECTIN4, Nectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN4Q96NY8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN4Q96NY8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms