Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NEUROD6Q96NK8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEUROD6Q96NK8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEUROD6Q96NK8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NEUROD6Q96NK8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD6Q96NK8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD6Q96NK8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD6Q96NK8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD6Q96NK8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD6Q96NK8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD6Q96NK8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD6Q96NK8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD6Q96NK8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD6Q96NK8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD6Q96NK8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD6Q96NK8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD6Q96NK8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD6Q96NK8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD6Q96NK8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD6Q96NK8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD6Q96NK8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD6Q96NK8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD6Q96NK8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD6Q96NK8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD6Q96NK8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD6Q96NK8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD6Q96NK8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms