Protein–RNA interactions for Protein: Q96N28

PRELID3A, PRELI domain containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3AQ96N28 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRELID3AQ96N28 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms