Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms