Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
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