Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SENP8Q96LD8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SENP8Q96LD8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 574.6 ms