Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MS4A4AQ96JQ5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms