Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS50Q96JG6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms