Protein–RNA interactions for Protein: Q96HM7

PCED1B, PC-esterase domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCED1BQ96HM7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCED1BQ96HM7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCED1BQ96HM7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms