Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms