Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTERF3Q96E29 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms